工商管理系成立于1999年，前身为1986年成立的技术经济教研室和工业经济教研室，其所依托的工商管理专业是黑龙江省重点专业，连续多年被《中国大学学科及专业排名》评为A++专业。现有企业创新研究所（黑龙江省人文社科重点研究基地、海燕策略线路1“兴海”学术团队）、绿色技术管理与科技创业研究中心（海燕策略线路1“兴海”学术团队）、神经工业工程实验室、知识产权管理研究所、IEVM实验室等研究机构；承担国家社会科学基金重点项目、国家社会科学基金一般项目、国家自然科学基金项目等国家级项目40余项，承担教育部人文社会科学基金等省部级项目100余项；在国内外高水平期刊发表学术文章1500余篇，获得省部级以上学术奖励60余项；拥有省级精品课3门，获省级教改立项10余项、全国多媒体课件大赛一等奖、国际企业管理挑战赛全国一等奖、创青春大学生创业大赛全国一等奖10余项；与美国加州理工大学等国外著名大学建立了长期稳定的合作关系，先后有20多名教师赴国外大学进行访问与合作研究；助力地方经济发展，为省市各级地方政府制定发展规划，与中国国际工程咨询公司、中国船舶重工集团、中国海洋石油总公司等国内外企业建立了密切的业务合作和咨询关系。